Wyposażenie laboratorium stanowi skaningowy mikroskop elektronowy (SEM) ThermoFisher Scientific Helios 5 UX wykorzystujący działo elektronowe z emisją polową (Schottky Field Emission Gun). Mikroskop wyposażony jest w spektrometr EDS (z ang. energy-dispersive X-ray spectroscopy) EDAX Octane Elite Plus pozwalający na prowadzenie analizy składu chemicznego w mikroobszarach oraz kamerę EDAX Velocity Pro wykorzystywaną w technice dyfrakcji elektronów wstecznie rozproszonych (EBSD) pozwalającą na badania orientacji krystalograficznych ziaren w materiale. Mikroskop wyposażony jest ponadto w kolumnę jonów Ga+ pozwalającą na preparatykę próbek dla mikroskopii transmisyjnej (TEM) techniką focused ion beam (FIB) jak też rekonstrukcję 3D mikrostruktury materiałów.

Wyposażenie laboratorium transmisyjnej mikroskopii elektronowej (TEM) stanowi wysokorozdzielczy mikroskop JEOL JEM F-200 wyposażony w działo elektronowe z emisją polową (Schottky Field Emission Gun). Mikroskop pozwala na prowadzenie obserwacji zarówno w trybie TEM (rozdzielczość: 0.06 nm) jak i w trybie skaningowo-transmisyjnym STEM (rozdzielczość: 0.16 nm). Ponadto mikroskop wyposażony jest w dwudetektorowy system mikroanalizy rentgenowskiej EDS (z ang. energy-dispersive X-ray spectroscopy) pozwalający na prowadzenie analizy składu chemicznego w trybie punktowym, liniowym lub poprzez mapowanie rozkładu pierwiastków chemicznych. Badania prowadzone są na próbkach o grubości poniżej 100 nm wykonanych metodami polerowania elektrolitycznego lub wiązką jonów. Laboratorium dysponuje również uchwytami do prowadzenia obserwacji in-situ w wysokiej temperaturze (do 1000°C) oraz badań deformacji materiałów.