Reaktor MARIA funkcjonuje obecnie na podstawie licencji Państwowej Agencji Atomistyki. 20 sierpnia 2024 r. Narodowe Centrum Badań Jądrowych złożyło wniosek o wydanie nowego zezwolenia na eksploatację reaktora MARIA w oparciu o Rozporządzenie Rady Ministrów z dnia 30 sierpnia 2021 r. w sprawie dokumentów wymaganych przy składaniu wniosku o wydanie zezwolenia na wykonywanie działalności związanej z narażeniem na działanie promieniowania jonizującego albo przy zgłoszeniu wykonywania tej działalności.

Po wstępnej analizie, Państwowa Agencja Atomistyki przekazała prośbę o uzupełnienie dokumentacji. Wniosek został uzupełniony 23 września 2024 r.

Narodowe Centrum Badań Jądrowych i Państwowa Agencja Atomistyki pozostają w ciągłym kontakcie. Pracownicy Agencji analizowali dokumentację, zadawali pytania oraz zwracali się do Centrum o kolejne wyjaśnienia i uzupełnienia. Odpowiedzi na pytania były udzielane terminowo.

W ramach obowiązującego zezwolenia w reaktorze MARIA przeprowadzono dwukrotnie ocenę okresową bezpieczeństwa: pierwszą w 2018 r. oraz drugą w 2022 r. W 2023 r. przedstawiono Państwowej Agencji Atomistyki raport z oceny. Ocena okresowa nie należy do dokumentów wyszczególnionych w rozporządzeniu, na podstawie którego Instytut ubiega się o licencję.

Od 31 marca do 8 maja 2025 r. planowana jest przerwa techniczna w działaniu reaktora MARIA. Dyrekcja Instytutu podejmuje działania, aby do tego czasu proces licencjonowania zakończył się sukcesem.